В соответствии с принятой Федеральной целевой программой «Жилище2002-2010 годы» в Карачаево-Черкесии началось развиваться ипотечное жилищное кредитование.
В республике разработана программа «Развитие системы ипотечного жилищного кредитования и строительства доступного жилья в КЧР на 2006-2008 годы», которая регламентировала работу по оформлению и выдачи кредитов.
Оператором стало «Карачаево-Черкесское агентство ипотечного кредитования» с уставным капиталом 8,0млн. рублей, где доля Правительства Карачаево-Черкесии составляет 51%.

Благодаря тому, что Правительством республики в 2006 году выделено 4,1 млн. рублей для увеличения уставного капитала регионального оператора, в декабре 2006 года в республике реально начала работать система ипотечного кредитования с участием Агентства через Ставропольский банк.

В текущем году банками Карачаево-Черкесии по собственным программам выданы ипотечные кредиты на сумму 13,6 млн. рублей.

В рамках реализации федеральной целевой программы «Жилище» в Карачаево-Черкесии работают следующие подпрограммы:
-обеспечение жильем молодых семей
- обеспечение жильем определенных категорий граждан, перед которыми государство имеет обязательства
- обеспечение жильем инвалидов и ветеранов.
По программе «Социальное развитие села до 2010 года» предусмотрены
- мероприятия по развитию жилищного строительства в сельской местности
- мероприятия по обеспечению жильем молодых семей и молодых специалистов на селе.
Общая сумма, предусмотренных средств на эти цели в 2007 году составляет 101,6 млн. рублей. В 2006 году за счет субсидий, выделенных в рамках этих подпрограмм, улучшили жилищные условия 254 семьи.